MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	ACA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740029
2	NC_009767	TCGATA	2	12	467	478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156740029
3	NC_009767	CG	3	6	496	501	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
4	NC_009767	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
5	NC_009767	AAG	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
6	NC_009767	GTC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
7	NC_009767	GTCTGA	2	12	612	623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156740029
8	NC_009767	GGCA	2	8	649	656	25 %	0 %	50 %	25 %	156740029
9	NC_009767	GC	3	6	738	743	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
10	NC_009767	TCA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
11	NC_009767	GGC	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
12	NC_009767	CAG	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
13	NC_009767	GAG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
14	NC_009767	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
15	NC_009767	TGA	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
16	NC_009767	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
17	NC_009767	T	6	6	1144	1149	0 %	100 %	0 %	0 %	156740029
18	NC_009767	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
19	NC_009767	ATCGG	2	10	1197	1206	20 %	20 %	40 %	20 %	156740029
20	NC_009767	GAA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
21	NC_009767	TCG	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
22	NC_009767	GC	3	6	1314	1319	0 %	0 %	50 %	50 %	156740029
23	NC_009767	TGAT	2	8	1358	1365	25 %	50 %	25 %	0 %	156740029
24	NC_009767	GCG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
25	NC_009767	CTCC	2	8	1575	1582	0 %	25 %	0 %	75 %	156740029
26	NC_009767	GAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
27	NC_009767	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740029
28	NC_009767	ACG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
29	NC_009767	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
30	NC_009767	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
31	NC_009767	GCT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
32	NC_009767	GCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
33	NC_009767	CGG	2	6	2069	2074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
34	NC_009767	CCG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
35	NC_009767	GTG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740030
36	NC_009767	TAC	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
37	NC_009767	AGGC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	50 %	25 %	156740030
38	NC_009767	CGG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
39	NC_009767	CTGG	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	156740030
40	NC_009767	CGC	2	6	2465	2470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
41	NC_009767	GGC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
42	NC_009767	CCG	2	6	2514	2519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
43	NC_009767	AGA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740030
44	NC_009767	CGT	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
45	NC_009767	ACT	3	9	2578	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
46	NC_009767	TGGA	2	8	2658	2665	25 %	25 %	50 %	0 %	156740030
47	NC_009767	GC	3	6	2683	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	156740030
48	NC_009767	GCG	2	6	2826	2831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
49	NC_009767	GAT	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
50	NC_009767	GCG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
51	NC_009767	CGC	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
52	NC_009767	CAGA	2	8	3076	3083	50 %	0 %	25 %	25 %	156740030
53	NC_009767	CTA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
54	NC_009767	CGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
55	NC_009767	AATC	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	156740031
56	NC_009767	TAC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
57	NC_009767	TCG	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
58	NC_009767	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	156740031
59	NC_009767	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
60	NC_009767	GTT	2	6	3385	3390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
61	NC_009767	AGC	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740031
62	NC_009767	CAC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740032
63	NC_009767	CGGG	2	8	3593	3600	0 %	0 %	75 %	25 %	156740032
64	NC_009767	CGG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
65	NC_009767	GTA	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740032
66	NC_009767	GAG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740032
67	NC_009767	TTTC	2	8	3810	3817	0 %	75 %	0 %	25 %	156740032
68	NC_009767	CCT	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740032
69	NC_009767	GCG	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
70	NC_009767	CGG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
71	NC_009767	CGT	3	9	3953	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740032
72	NC_009767	CAGG	2	8	3967	3974	25 %	0 %	50 %	25 %	156740033
73	NC_009767	CAG	5	15	4047	4061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
74	NC_009767	AGC	3	9	4066	4074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
75	NC_009767	CG	3	6	4093	4098	0 %	0 %	50 %	50 %	156740033
76	NC_009767	GCC	2	6	4287	4292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
77	NC_009767	GCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
78	NC_009767	ACC	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
79	NC_009767	CGG	3	9	4417	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
80	NC_009767	GTT	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740034
81	NC_009767	GAC	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740034
82	NC_009767	CAGCG	2	10	4463	4472	20 %	0 %	40 %	40 %	156740034
83	NC_009767	AGCGCC	2	12	4476	4487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740034
84	NC_009767	CCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
85	NC_009767	GTG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740034
86	NC_009767	TCG	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740034
87	NC_009767	CAC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
88	NC_009767	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
89	NC_009767	GAC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
90	NC_009767	GC	4	8	4885	4892	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
91	NC_009767	GCG	2	6	4899	4904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
92	NC_009767	GCGGT	2	10	4919	4928	0 %	20 %	60 %	20 %	156740035
93	NC_009767	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
94	NC_009767	GC	3	6	4996	5001	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
95	NC_009767	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740035
96	NC_009767	GCT	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
97	NC_009767	ACA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
98	NC_009767	TCG	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
99	NC_009767	CG	3	6	5230	5235	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
100	NC_009767	TGC	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
101	NC_009767	GC	3	6	5277	5282	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
102	NC_009767	GC	3	6	5363	5368	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
103	NC_009767	CGTC	2	8	5397	5404	0 %	25 %	25 %	50 %	156740035
104	NC_009767	GC	4	8	5475	5482	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
105	NC_009767	CAG	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
106	NC_009767	ACG	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
107	NC_009767	GCGCCA	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740035
108	NC_009767	TGC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
109	NC_009767	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
110	NC_009767	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
111	NC_009767	GC	3	6	5811	5816	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
112	NC_009767	ACA	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
113	NC_009767	CAT	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
114	NC_009767	GCC	2	6	5841	5846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
115	NC_009767	GGC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
116	NC_009767	CGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
117	NC_009767	GCG	2	6	5925	5930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
118	NC_009767	ATCG	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	156740035
119	NC_009767	CAG	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
120	NC_009767	CCG	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
121	NC_009767	GCC	2	6	6060	6065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
122	NC_009767	GCA	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
123	NC_009767	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
124	NC_009767	CACG	2	8	6175	6182	25 %	0 %	25 %	50 %	156740035
125	NC_009767	GGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740035
126	NC_009767	GTA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740035
127	NC_009767	GAG	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740035
128	NC_009767	GCG	2	6	6319	6324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
129	NC_009767	GC	3	6	6351	6356	0 %	0 %	50 %	50 %	156740035
130	NC_009767	GC	3	6	6957	6962	0 %	0 %	50 %	50 %	156740036
131	NC_009767	GCG	2	6	7061	7066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740036
132	NC_009767	CAG	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
133	NC_009767	ATC	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740036
134	NC_009767	GCA	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
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137	NC_009767	TCG	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740036
138	NC_009767	GCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
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151	NC_009767	TCA	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740037
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153	NC_009767	TCTA	2	8	8184	8191	25 %	50 %	0 %	25 %	156740037
154	NC_009767	CGCA	2	8	8288	8295	25 %	0 %	25 %	50 %	156740037
155	NC_009767	ATG	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740037
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159	NC_009767	CGAT	2	8	8433	8440	25 %	25 %	25 %	25 %	156740037
160	NC_009767	GGC	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740037
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252	NC_009767	GCT	2	6	14276	14281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740042
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258	NC_009767	GGC	2	6	14560	14565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740042
259	NC_009767	CAC	2	6	14593	14598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740042
260	NC_009767	ATC	2	6	14635	14640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740042
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262	NC_009767	GC	3	6	14693	14698	0 %	0 %	50 %	50 %	156740042
263	NC_009767	CG	3	6	14715	14720	0 %	0 %	50 %	50 %	156740042
264	NC_009767	GCG	2	6	14903	14908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740043
265	NC_009767	TCG	2	6	14951	14956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740043
266	NC_009767	CG	3	6	15003	15008	0 %	0 %	50 %	50 %	156740043
267	NC_009767	GCT	2	6	15023	15028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740043
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272	NC_009767	GAT	2	6	15110	15115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740043
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287	NC_009767	GC	3	6	15672	15677	0 %	0 %	50 %	50 %	156740043
288	NC_009767	GCC	2	6	15691	15696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740043
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291	NC_009767	GGT	2	6	15751	15756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740043
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294	NC_009767	GGC	2	6	15915	15920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740043
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299	NC_009767	CGT	2	6	16136	16141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740043
300	NC_009767	GC	4	8	16358	16365	0 %	0 %	50 %	50 %	156740043
301	NC_009767	TCG	2	6	16585	16590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740044
302	NC_009767	TGA	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740044
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373	NC_009767	CGGG	2	8	22724	22731	0 %	0 %	75 %	25 %	156740048
374	NC_009767	CAGG	2	8	22733	22740	25 %	0 %	50 %	25 %	156740048
375	NC_009767	TCG	2	6	22770	22775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740048
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378	NC_009767	GCGCCA	2	12	22861	22872	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740048
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380	NC_009767	ACC	2	6	22980	22985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740048
381	NC_009767	CGA	2	6	22999	23004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740048
382	NC_009767	GCG	2	6	23086	23091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740048
383	NC_009767	TCG	2	6	23163	23168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740048
384	NC_009767	CCTC	2	8	23184	23191	0 %	25 %	0 %	75 %	156740048
385	NC_009767	GCGCC	2	10	23197	23206	0 %	0 %	40 %	60 %	156740048
386	NC_009767	CGC	2	6	23269	23274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740048
387	NC_009767	TTCC	2	8	23282	23289	0 %	50 %	0 %	50 %	156740048
388	NC_009767	CAAAGA	2	12	23335	23346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156740048
389	NC_009767	CGT	2	6	23425	23430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740048
390	NC_009767	CTC	2	6	23432	23437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740048
391	NC_009767	GC	5	10	23440	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	156740048
392	NC_009767	GC	3	6	23459	23464	0 %	0 %	50 %	50 %	156740048
393	NC_009767	CCGCC	2	10	23488	23497	0 %	0 %	20 %	80 %	156740048
394	NC_009767	GTC	2	6	23512	23517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740048
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404	NC_009767	CGT	2	6	26140	26145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
405	NC_009767	CGC	2	6	26193	26198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
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